Luonnonhaittakorvauksen kansallista lisäosaa maksetaan samalle peltoalalle, joka on luonnonhaittakorvauskelpoista ja jolle maksetaan osarahoitteista luonnonhaittakorvausta. Lisäosan maksatukseen on vuosittain varattu noin 120 miljoonaa euroa. Kasvinviljelytiloille maksetaan perusosa, kotieläintiloille sekä perusosa että kotieläintilan korotus.
Luonnonhaittakorvauksen kansalliseen lisäosaan voi sitoutua vain samanaikaisesti ja samaksi ajanjaksoksi kuin luonnonhaittakorvaussitoumukseen.
Lisäosasitoumusta tehtäessä tila ilmoittautuu koko sitoumuskauden ajaksi joko kotieläintilaksi tai kasvinviljelytilaksi. Jos kotieläintila lopettaa eläintenpidon kesken sitoumuskauden, tila muutetaan kasvinviljelytilaksi. Kasvinviljelytilan pääsy kotieläintilaksi kesken sitoumuskauden on rajattu tiettyihin erityistilanteisiin.
Uuden viisivuotisen lisäosasitoumuksen vuonna 2011 voivat antaa mm. ne viljelijät, joilla vuonna 2006 alkanut luonnonhaittakorvaussitoumus päättyi.
Tuen hakemiseen liittyvät yksityiskohdat löytyvät Hakuoppaan 2011 luvusta 6.3 ja kansallisen lisäosan sitoumusehdoista.